Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACHD1Q5VU97 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACHD1Q5VU97 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACHD1Q5VU97 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACHD1Q5VU97 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACHD1Q5VU97 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACHD1Q5VU97 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACHD1Q5VU97 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACHD1Q5VU97 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CACHD1Q5VU97 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACHD1Q5VU97 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACHD1Q5VU97 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms