Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C9orf135Q5VTT2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9orf135Q5VTT2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf135Q5VTT2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf135Q5VTT2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms