Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1A1P5Q5VTE0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EEF1A1P5Q5VTE0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1A1P5Q5VTE0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1A1P5Q5VTE0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1A1P5Q5VTE0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1A1P5Q5VTE0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EEF1A1P5Q5VTE0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EEF1A1P5Q5VTE0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEF1A1P5Q5VTE0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms