Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf15Q5UBV8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms