Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCQ9

MAGI3, Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGI3Q5TCQ9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
MAGI3Q5TCQ9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
MAGI3Q5TCQ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
MAGI3Q5TCQ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
MAGI3Q5TCQ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
MAGI3Q5TCQ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
MAGI3Q5TCQ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
MAGI3Q5TCQ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
MAGI3Q5TCQ9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
MAGI3Q5TCQ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC42.32■■■■■ 4.37
MAGI3Q5TCQ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
MAGI3Q5TCQ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
MAGI3Q5TCQ9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
MAGI3Q5TCQ9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
MAGI3Q5TCQ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
MAGI3Q5TCQ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
MAGI3Q5TCQ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
MAGI3Q5TCQ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
MAGI3Q5TCQ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
MAGI3Q5TCQ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
MAGI3Q5TCQ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
MAGI3Q5TCQ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
MAGI3Q5TCQ9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
MAGI3Q5TCQ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
MAGI3Q5TCQ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
MAGI3Q5TCQ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
MAGI3Q5TCQ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
MAGI3Q5TCQ9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
MAGI3Q5TCQ9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
MAGI3Q5TCQ9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
MAGI3Q5TCQ9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
MAGI3Q5TCQ9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
MAGI3Q5TCQ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
MAGI3Q5TCQ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
MAGI3Q5TCQ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
MAGI3Q5TCQ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
MAGI3Q5TCQ9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
MAGI3Q5TCQ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
MAGI3Q5TCQ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
MAGI3Q5TCQ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
MAGI3Q5TCQ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
MAGI3Q5TCQ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
MAGI3Q5TCQ9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
MAGI3Q5TCQ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
MAGI3Q5TCQ9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
MAGI3Q5TCQ9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
MAGI3Q5TCQ9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
MAGI3Q5TCQ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
MAGI3Q5TCQ9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
MAGI3Q5TCQ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
MAGI3Q5TCQ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
MAGI3Q5TCQ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
MAGI3Q5TCQ9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
MAGI3Q5TCQ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
MAGI3Q5TCQ9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
MAGI3Q5TCQ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
MAGI3Q5TCQ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
MAGI3Q5TCQ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
MAGI3Q5TCQ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
MAGI3Q5TCQ9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
MAGI3Q5TCQ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
MAGI3Q5TCQ9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
MAGI3Q5TCQ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
MAGI3Q5TCQ9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
MAGI3Q5TCQ9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
MAGI3Q5TCQ9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
MAGI3Q5TCQ9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
MAGI3Q5TCQ9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
MAGI3Q5TCQ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms