Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4I8

C6orf52, Putative uncharacterized protein C6orf52, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf52Q5T4I8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C6orf52Q5T4I8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C6orf52Q5T4I8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C6orf52Q5T4I8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C6orf52Q5T4I8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C6orf52Q5T4I8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C6orf52Q5T4I8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C6orf52Q5T4I8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C6orf52Q5T4I8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C6orf52Q5T4I8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf52Q5T4I8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf52Q5T4I8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf52Q5T4I8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf52Q5T4I8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf52Q5T4I8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C6orf52Q5T4I8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C6orf52Q5T4I8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C6orf52Q5T4I8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C6orf52Q5T4I8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C6orf52Q5T4I8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C6orf52Q5T4I8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C6orf52Q5T4I8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C6orf52Q5T4I8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C6orf52Q5T4I8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C6orf52Q5T4I8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C6orf52Q5T4I8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C6orf52Q5T4I8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C6orf52Q5T4I8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C6orf52Q5T4I8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C6orf52Q5T4I8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C6orf52Q5T4I8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C6orf52Q5T4I8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C6orf52Q5T4I8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms