Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2S8

ARMC4, Armadillo repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC4Q5T2S8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARMC4Q5T2S8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARMC4Q5T2S8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARMC4Q5T2S8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARMC4Q5T2S8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARMC4Q5T2S8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARMC4Q5T2S8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms