Protein–RNA interactions for Protein: Q5T160

RARS2, Probable arginine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARS2Q5T160 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RARS2Q5T160 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RARS2Q5T160 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RARS2Q5T160 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RARS2Q5T160 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RARS2Q5T160 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RARS2Q5T160 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RARS2Q5T160 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RARS2Q5T160 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARS2Q5T160 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RARS2Q5T160 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RARS2Q5T160 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARS2Q5T160 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARS2Q5T160 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARS2Q5T160 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARS2Q5T160 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARS2Q5T160 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARS2Q5T160 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RARS2Q5T160 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RARS2Q5T160 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARS2Q5T160 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARS2Q5T160 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARS2Q5T160 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARS2Q5T160 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARS2Q5T160 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARS2Q5T160 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARS2Q5T160 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARS2Q5T160 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARS2Q5T160 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARS2Q5T160 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RARS2Q5T160 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RARS2Q5T160 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms