Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FRMPD3Q5JV73 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms