Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIN3Q5JUX0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIN3Q5JUX0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPIN3Q5JUX0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIN3Q5JUX0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIN3Q5JUX0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPIN3Q5JUX0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms