Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPM1JQ5JR12 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPM1JQ5JR12 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPM1JQ5JR12 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPM1JQ5JR12 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPM1JQ5JR12 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPM1JQ5JR12 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPM1JQ5JR12 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPM1JQ5JR12 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPM1JQ5JR12 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPM1JQ5JR12 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPM1JQ5JR12 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPM1JQ5JR12 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPM1JQ5JR12 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PPM1JQ5JR12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPM1JQ5JR12 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PPM1JQ5JR12 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPM1JQ5JR12 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPM1JQ5JR12 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPM1JQ5JR12 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPM1JQ5JR12 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPM1JQ5JR12 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPM1JQ5JR12 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPM1JQ5JR12 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PPM1JQ5JR12 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPM1JQ5JR12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPM1JQ5JR12 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPM1JQ5JR12 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPM1JQ5JR12 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPM1JQ5JR12 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPM1JQ5JR12 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPM1JQ5JR12 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPM1JQ5JR12 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPM1JQ5JR12 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PPM1JQ5JR12 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPM1JQ5JR12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PPM1JQ5JR12 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPM1JQ5JR12 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPM1JQ5JR12 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPM1JQ5JR12 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPM1JQ5JR12 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPM1JQ5JR12 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPM1JQ5JR12 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPM1JQ5JR12 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPM1JQ5JR12 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPM1JQ5JR12 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPM1JQ5JR12 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPM1JQ5JR12 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPM1JQ5JR12 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPM1JQ5JR12 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPM1JQ5JR12 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPM1JQ5JR12 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPM1JQ5JR12 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPM1JQ5JR12 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPM1JQ5JR12 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPM1JQ5JR12 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPM1JQ5JR12 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPM1JQ5JR12 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPM1JQ5JR12 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPM1JQ5JR12 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPM1JQ5JR12 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPM1JQ5JR12 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPM1JQ5JR12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPM1JQ5JR12 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPM1JQ5JR12 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPM1JQ5JR12 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPM1JQ5JR12 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPM1JQ5JR12 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPM1JQ5JR12 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPM1JQ5JR12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPM1JQ5JR12 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPM1JQ5JR12 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPM1JQ5JR12 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPM1JQ5JR12 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPM1JQ5JR12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PPM1JQ5JR12 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PPM1JQ5JR12 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPM1JQ5JR12 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPM1JQ5JR12 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPM1JQ5JR12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPM1JQ5JR12 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms