Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Trpm3Q5F4S9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Trpm3Q5F4S9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Trpm3Q5F4S9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Trpm3Q5F4S9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Trpm3Q5F4S9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Trpm3Q5F4S9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Trpm3Q5F4S9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Trpm3Q5F4S9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Trpm3Q5F4S9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Trpm3Q5F4S9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Trpm3Q5F4S9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Trpm3Q5F4S9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Trpm3Q5F4S9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Trpm3Q5F4S9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Trpm3Q5F4S9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Trpm3Q5F4S9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Trpm3Q5F4S9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Trpm3Q5F4S9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Trpm3Q5F4S9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Trpm3Q5F4S9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Trpm3Q5F4S9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Trpm3Q5F4S9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Trpm3Q5F4S9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Trpm3Q5F4S9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Trpm3Q5F4S9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Trpm3Q5F4S9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Trpm3Q5F4S9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Trpm3Q5F4S9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Trpm3Q5F4S9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trpm3Q5F4S9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trpm3Q5F4S9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Trpm3Q5F4S9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Trpm3Q5F4S9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Trpm3Q5F4S9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Trpm3Q5F4S9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Trpm3Q5F4S9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trpm3Q5F4S9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trpm3Q5F4S9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trpm3Q5F4S9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Trpm3Q5F4S9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Trpm3Q5F4S9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trpm3Q5F4S9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trpm3Q5F4S9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Trpm3Q5F4S9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Trpm3Q5F4S9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Trpm3Q5F4S9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trpm3Q5F4S9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trpm3Q5F4S9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trpm3Q5F4S9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trpm3Q5F4S9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trpm3Q5F4S9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trpm3Q5F4S9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trpm3Q5F4S9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Trpm3Q5F4S9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trpm3Q5F4S9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trpm3Q5F4S9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Trpm3Q5F4S9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trpm3Q5F4S9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trpm3Q5F4S9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Trpm3Q5F4S9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Trpm3Q5F4S9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Trpm3Q5F4S9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trpm3Q5F4S9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Trpm3Q5F4S9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Trpm3Q5F4S9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trpm3Q5F4S9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trpm3Q5F4S9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trpm3Q5F4S9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trpm3Q5F4S9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Trpm3Q5F4S9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Trpm3Q5F4S9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Trpm3Q5F4S9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Trpm3Q5F4S9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trpm3Q5F4S9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trpm3Q5F4S9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trpm3Q5F4S9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Trpm3Q5F4S9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Trpm3Q5F4S9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Trpm3Q5F4S9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Trpm3Q5F4S9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Trpm3Q5F4S9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Trpm3Q5F4S9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Trpm3Q5F4S9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Trpm3Q5F4S9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Trpm3Q5F4S9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Trpm3Q5F4S9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Trpm3Q5F4S9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trpm3Q5F4S9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Trpm3Q5F4S9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trpm3Q5F4S9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trpm3Q5F4S9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trpm3Q5F4S9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trpm3Q5F4S9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trpm3Q5F4S9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trpm3Q5F4S9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trpm3Q5F4S9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Trpm3Q5F4S9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Trpm3Q5F4S9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Trpm3Q5F4S9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms