Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJH7

YIF1B, Protein YIF1B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIF1BQ5BJH7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIF1BQ5BJH7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIF1BQ5BJH7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIF1BQ5BJH7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIF1BQ5BJH7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YIF1BQ5BJH7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIF1BQ5BJH7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIF1BQ5BJH7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIF1BQ5BJH7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIF1BQ5BJH7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIF1BQ5BJH7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIF1BQ5BJH7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIF1BQ5BJH7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIF1BQ5BJH7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
YIF1BQ5BJH7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YIF1BQ5BJH7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YIF1BQ5BJH7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIF1BQ5BJH7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIF1BQ5BJH7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIF1BQ5BJH7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIF1BQ5BJH7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIF1BQ5BJH7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIF1BQ5BJH7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIF1BQ5BJH7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIF1BQ5BJH7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIF1BQ5BJH7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIF1BQ5BJH7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIF1BQ5BJH7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms