Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KHDC3LQ587J8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KHDC3LQ587J8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KHDC3LQ587J8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KHDC3LQ587J8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KHDC3LQ587J8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KHDC3LQ587J8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KHDC3LQ587J8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KHDC3LQ587J8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KHDC3LQ587J8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KHDC3LQ587J8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KHDC3LQ587J8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KHDC3LQ587J8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KHDC3LQ587J8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KHDC3LQ587J8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KHDC3LQ587J8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KHDC3LQ587J8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KHDC3LQ587J8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KHDC3LQ587J8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KHDC3LQ587J8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KHDC3LQ587J8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KHDC3LQ587J8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KHDC3LQ587J8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KHDC3LQ587J8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KHDC3LQ587J8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms