Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF1BQ53T94 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TAF1BQ53T94 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1BQ53T94 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF1BQ53T94 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1BQ53T94 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1BQ53T94 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1BQ53T94 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1BQ53T94 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1BQ53T94 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1BQ53T94 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1BQ53T94 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1BQ53T94 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1BQ53T94 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1BQ53T94 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1BQ53T94 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1BQ53T94 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1BQ53T94 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1BQ53T94 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1BQ53T94 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1BQ53T94 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1BQ53T94 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1BQ53T94 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1BQ53T94 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1BQ53T94 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1BQ53T94 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1BQ53T94 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1BQ53T94 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1BQ53T94 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1BQ53T94 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1BQ53T94 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1BQ53T94 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF1BQ53T94 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1BQ53T94 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1BQ53T94 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1BQ53T94 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1BQ53T94 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1BQ53T94 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF1BQ53T94 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF1BQ53T94 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TAF1BQ53T94 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TAF1BQ53T94 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1BQ53T94 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1BQ53T94 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1BQ53T94 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1BQ53T94 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1BQ53T94 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1BQ53T94 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms