Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGAP29Q52LW3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGAP29Q52LW3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGAP29Q52LW3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGAP29Q52LW3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGAP29Q52LW3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGAP29Q52LW3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGAP29Q52LW3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGAP29Q52LW3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGAP29Q52LW3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGAP29Q52LW3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARHGAP29Q52LW3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGAP29Q52LW3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARHGAP29Q52LW3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGAP29Q52LW3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP29Q52LW3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP29Q52LW3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP29Q52LW3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP29Q52LW3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP29Q52LW3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP29Q52LW3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP29Q52LW3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP29Q52LW3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP29Q52LW3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP29Q52LW3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGAP29Q52LW3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP29Q52LW3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP29Q52LW3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGAP29Q52LW3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGAP29Q52LW3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGAP29Q52LW3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGAP29Q52LW3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGAP29Q52LW3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGAP29Q52LW3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGAP29Q52LW3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP29Q52LW3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP29Q52LW3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP29Q52LW3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGAP29Q52LW3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP29Q52LW3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP29Q52LW3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGAP29Q52LW3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGAP29Q52LW3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGAP29Q52LW3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP29Q52LW3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP29Q52LW3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP29Q52LW3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGAP29Q52LW3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGAP29Q52LW3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP29Q52LW3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP29Q52LW3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP29Q52LW3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP29Q52LW3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP29Q52LW3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP29Q52LW3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP29Q52LW3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP29Q52LW3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP29Q52LW3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP29Q52LW3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP29Q52LW3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP29Q52LW3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP29Q52LW3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP29Q52LW3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGAP29Q52LW3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGAP29Q52LW3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms