Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM259Q4ZIN3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM259Q4ZIN3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM259Q4ZIN3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM259Q4ZIN3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM259Q4ZIN3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM259Q4ZIN3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM259Q4ZIN3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM259Q4ZIN3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM259Q4ZIN3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM259Q4ZIN3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM259Q4ZIN3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM259Q4ZIN3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM259Q4ZIN3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM259Q4ZIN3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM259Q4ZIN3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM259Q4ZIN3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM259Q4ZIN3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM259Q4ZIN3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM259Q4ZIN3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM259Q4ZIN3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM259Q4ZIN3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM259Q4ZIN3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms