Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Shank3Q4ACU6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Shank3Q4ACU6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Shank3Q4ACU6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Shank3Q4ACU6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Shank3Q4ACU6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Shank3Q4ACU6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Shank3Q4ACU6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Shank3Q4ACU6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Shank3Q4ACU6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Shank3Q4ACU6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Shank3Q4ACU6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Shank3Q4ACU6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Shank3Q4ACU6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Shank3Q4ACU6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Shank3Q4ACU6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Shank3Q4ACU6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Shank3Q4ACU6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Shank3Q4ACU6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Shank3Q4ACU6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Shank3Q4ACU6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Shank3Q4ACU6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Shank3Q4ACU6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Shank3Q4ACU6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Shank3Q4ACU6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Shank3Q4ACU6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Shank3Q4ACU6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Shank3Q4ACU6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Shank3Q4ACU6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Shank3Q4ACU6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Shank3Q4ACU6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Shank3Q4ACU6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Shank3Q4ACU6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Shank3Q4ACU6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Shank3Q4ACU6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Shank3Q4ACU6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Shank3Q4ACU6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Shank3Q4ACU6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Shank3Q4ACU6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Shank3Q4ACU6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Shank3Q4ACU6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Shank3Q4ACU6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Shank3Q4ACU6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Shank3Q4ACU6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Shank3Q4ACU6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Shank3Q4ACU6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Shank3Q4ACU6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Shank3Q4ACU6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Shank3Q4ACU6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Shank3Q4ACU6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Shank3Q4ACU6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Shank3Q4ACU6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Shank3Q4ACU6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Shank3Q4ACU6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Shank3Q4ACU6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Shank3Q4ACU6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Shank3Q4ACU6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Shank3Q4ACU6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Shank3Q4ACU6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Shank3Q4ACU6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Shank3Q4ACU6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Shank3Q4ACU6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Shank3Q4ACU6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Shank3Q4ACU6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Shank3Q4ACU6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Shank3Q4ACU6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Shank3Q4ACU6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Shank3Q4ACU6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Shank3Q4ACU6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Shank3Q4ACU6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Shank3Q4ACU6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Shank3Q4ACU6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Shank3Q4ACU6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Shank3Q4ACU6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Shank3Q4ACU6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Shank3Q4ACU6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Shank3Q4ACU6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Shank3Q4ACU6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Shank3Q4ACU6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Shank3Q4ACU6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Shank3Q4ACU6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Shank3Q4ACU6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Shank3Q4ACU6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Shank3Q4ACU6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Shank3Q4ACU6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms