Protein–RNA interactions for Protein: Q49A17

GALNTL6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 6, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNTL6Q49A17 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GALNTL6Q49A17 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GALNTL6Q49A17 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GALNTL6Q49A17 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GALNTL6Q49A17 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GALNTL6Q49A17 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GALNTL6Q49A17 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GALNTL6Q49A17 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GALNTL6Q49A17 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GALNTL6Q49A17 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GALNTL6Q49A17 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GALNTL6Q49A17 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GALNTL6Q49A17 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GALNTL6Q49A17 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GALNTL6Q49A17 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GALNTL6Q49A17 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GALNTL6Q49A17 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GALNTL6Q49A17 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GALNTL6Q49A17 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GALNTL6Q49A17 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GALNTL6Q49A17 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GALNTL6Q49A17 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GALNTL6Q49A17 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GALNTL6Q49A17 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GALNTL6Q49A17 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GALNTL6Q49A17 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GALNTL6Q49A17 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GALNTL6Q49A17 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GALNTL6Q49A17 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GALNTL6Q49A17 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GALNTL6Q49A17 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GALNTL6Q49A17 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GALNTL6Q49A17 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GALNTL6Q49A17 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GALNTL6Q49A17 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GALNTL6Q49A17 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GALNTL6Q49A17 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GALNTL6Q49A17 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GALNTL6Q49A17 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GALNTL6Q49A17 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GALNTL6Q49A17 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GALNTL6Q49A17 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GALNTL6Q49A17 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GALNTL6Q49A17 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GALNTL6Q49A17 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GALNTL6Q49A17 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GALNTL6Q49A17 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GALNTL6Q49A17 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GALNTL6Q49A17 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GALNTL6Q49A17 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GALNTL6Q49A17 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GALNTL6Q49A17 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GALNTL6Q49A17 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms