Protein–RNA interactions for Protein: Q495B1

ANKDD1A, Ankyrin repeat and death domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKDD1AQ495B1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKDD1AQ495B1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKDD1AQ495B1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKDD1AQ495B1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKDD1AQ495B1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKDD1AQ495B1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKDD1AQ495B1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKDD1AQ495B1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKDD1AQ495B1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKDD1AQ495B1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKDD1AQ495B1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKDD1AQ495B1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKDD1AQ495B1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKDD1AQ495B1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKDD1AQ495B1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKDD1AQ495B1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKDD1AQ495B1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKDD1AQ495B1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKDD1AQ495B1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKDD1AQ495B1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKDD1AQ495B1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKDD1AQ495B1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKDD1AQ495B1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKDD1AQ495B1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKDD1AQ495B1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKDD1AQ495B1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKDD1AQ495B1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKDD1AQ495B1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKDD1AQ495B1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKDD1AQ495B1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKDD1AQ495B1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms