Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2W7

4930518I15Rik, RIKEN cDNA 4930518I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930518I15RikQ3V2W7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930518I15RikQ3V2W7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930518I15RikQ3V2W7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4930518I15RikQ3V2W7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930518I15RikQ3V2W7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930518I15RikQ3V2W7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930518I15RikQ3V2W7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4930518I15RikQ3V2W7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930518I15RikQ3V2W7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930518I15RikQ3V2W7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930518I15RikQ3V2W7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930518I15RikQ3V2W7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930518I15RikQ3V2W7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930518I15RikQ3V2W7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930518I15RikQ3V2W7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930518I15RikQ3V2W7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
4930518I15RikQ3V2W7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930518I15RikQ3V2W7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930518I15RikQ3V2W7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930518I15RikQ3V2W7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930518I15RikQ3V2W7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930518I15RikQ3V2W7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930518I15RikQ3V2W7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930518I15RikQ3V2W7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930518I15RikQ3V2W7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930518I15RikQ3V2W7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930518I15RikQ3V2W7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.1 ms