Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Garnl3Q3V0G7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Garnl3Q3V0G7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Garnl3Q3V0G7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Garnl3Q3V0G7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Garnl3Q3V0G7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Garnl3Q3V0G7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Garnl3Q3V0G7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Garnl3Q3V0G7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Garnl3Q3V0G7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Garnl3Q3V0G7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Garnl3Q3V0G7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Garnl3Q3V0G7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Garnl3Q3V0G7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Garnl3Q3V0G7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Garnl3Q3V0G7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Garnl3Q3V0G7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Garnl3Q3V0G7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Garnl3Q3V0G7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Garnl3Q3V0G7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Garnl3Q3V0G7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Garnl3Q3V0G7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Garnl3Q3V0G7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Garnl3Q3V0G7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Garnl3Q3V0G7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Garnl3Q3V0G7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Garnl3Q3V0G7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Garnl3Q3V0G7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Garnl3Q3V0G7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Garnl3Q3V0G7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Garnl3Q3V0G7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Garnl3Q3V0G7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Garnl3Q3V0G7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Garnl3Q3V0G7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Garnl3Q3V0G7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Garnl3Q3V0G7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Garnl3Q3V0G7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Garnl3Q3V0G7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Garnl3Q3V0G7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Garnl3Q3V0G7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Garnl3Q3V0G7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Garnl3Q3V0G7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Garnl3Q3V0G7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Garnl3Q3V0G7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms