Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm6Q3UZD5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm6Q3UZD5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm6Q3UZD5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm6Q3UZD5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm6Q3UZD5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm6Q3UZD5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm6Q3UZD5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm6Q3UZD5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm6Q3UZD5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm6Q3UZD5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm6Q3UZD5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm6Q3UZD5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm6Q3UZD5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm6Q3UZD5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm6Q3UZD5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm6Q3UZD5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm6Q3UZD5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm6Q3UZD5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm6Q3UZD5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm6Q3UZD5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm6Q3UZD5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm6Q3UZD5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm6Q3UZD5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm6Q3UZD5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm6Q3UZD5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm6Q3UZD5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm6Q3UZD5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm6Q3UZD5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm6Q3UZD5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm6Q3UZD5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm6Q3UZD5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm6Q3UZD5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm6Q3UZD5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm6Q3UZD5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm6Q3UZD5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm6Q3UZD5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm6Q3UZD5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm6Q3UZD5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm6Q3UZD5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm6Q3UZD5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm6Q3UZD5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm6Q3UZD5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm6Q3UZD5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm6Q3UZD5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm6Q3UZD5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm6Q3UZD5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm6Q3UZD5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm6Q3UZD5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm6Q3UZD5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm6Q3UZD5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms