Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV74

Itgb2l, Integrin beta-2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb2lQ3UV74 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb2lQ3UV74 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb2lQ3UV74 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb2lQ3UV74 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb2lQ3UV74 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itgb2lQ3UV74 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb2lQ3UV74 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb2lQ3UV74 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb2lQ3UV74 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb2lQ3UV74 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb2lQ3UV74 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb2lQ3UV74 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb2lQ3UV74 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb2lQ3UV74 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb2lQ3UV74 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb2lQ3UV74 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb2lQ3UV74 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb2lQ3UV74 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb2lQ3UV74 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb2lQ3UV74 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb2lQ3UV74 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb2lQ3UV74 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb2lQ3UV74 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb2lQ3UV74 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb2lQ3UV74 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb2lQ3UV74 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb2lQ3UV74 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb2lQ3UV74 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb2lQ3UV74 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb2lQ3UV74 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb2lQ3UV74 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb2lQ3UV74 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb2lQ3UV74 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb2lQ3UV74 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb2lQ3UV74 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb2lQ3UV74 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb2lQ3UV74 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb2lQ3UV74 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb2lQ3UV74 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb2lQ3UV74 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb2lQ3UV74 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb2lQ3UV74 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb2lQ3UV74 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb2lQ3UV74 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb2lQ3UV74 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itgb2lQ3UV74 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb2lQ3UV74 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb2lQ3UV74 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb2lQ3UV74 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb2lQ3UV74 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb2lQ3UV74 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb2lQ3UV74 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb2lQ3UV74 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb2lQ3UV74 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb2lQ3UV74 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb2lQ3UV74 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb2lQ3UV74 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb2lQ3UV74 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb2lQ3UV74 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb2lQ3UV74 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb2lQ3UV74 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb2lQ3UV74 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb2lQ3UV74 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb2lQ3UV74 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb2lQ3UV74 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb2lQ3UV74 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb2lQ3UV74 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms