Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skap2Q3UND0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Skap2Q3UND0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skap2Q3UND0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skap2Q3UND0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skap2Q3UND0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skap2Q3UND0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skap2Q3UND0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skap2Q3UND0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skap2Q3UND0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skap2Q3UND0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skap2Q3UND0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Skap2Q3UND0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skap2Q3UND0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skap2Q3UND0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skap2Q3UND0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skap2Q3UND0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Skap2Q3UND0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skap2Q3UND0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Skap2Q3UND0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Skap2Q3UND0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Skap2Q3UND0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Skap2Q3UND0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Skap2Q3UND0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Skap2Q3UND0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Skap2Q3UND0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Skap2Q3UND0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Skap2Q3UND0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Skap2Q3UND0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Skap2Q3UND0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Skap2Q3UND0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Skap2Q3UND0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Skap2Q3UND0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Skap2Q3UND0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skap2Q3UND0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Skap2Q3UND0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skap2Q3UND0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skap2Q3UND0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skap2Q3UND0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skap2Q3UND0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skap2Q3UND0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skap2Q3UND0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skap2Q3UND0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skap2Q3UND0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skap2Q3UND0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Skap2Q3UND0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skap2Q3UND0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Skap2Q3UND0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Skap2Q3UND0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Skap2Q3UND0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Skap2Q3UND0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Skap2Q3UND0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skap2Q3UND0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skap2Q3UND0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Skap2Q3UND0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Skap2Q3UND0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skap2Q3UND0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Skap2Q3UND0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skap2Q3UND0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skap2Q3UND0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skap2Q3UND0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skap2Q3UND0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skap2Q3UND0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Skap2Q3UND0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skap2Q3UND0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skap2Q3UND0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skap2Q3UND0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skap2Q3UND0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skap2Q3UND0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms