Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccser2Q3UHI0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccser2Q3UHI0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccser2Q3UHI0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccser2Q3UHI0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccser2Q3UHI0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccser2Q3UHI0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccser2Q3UHI0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccser2Q3UHI0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccser2Q3UHI0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccser2Q3UHI0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccser2Q3UHI0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccser2Q3UHI0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccser2Q3UHI0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccser2Q3UHI0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccser2Q3UHI0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccser2Q3UHI0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccser2Q3UHI0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccser2Q3UHI0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccser2Q3UHI0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccser2Q3UHI0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccser2Q3UHI0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccser2Q3UHI0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccser2Q3UHI0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccser2Q3UHI0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccser2Q3UHI0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccser2Q3UHI0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccser2Q3UHI0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccser2Q3UHI0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccser2Q3UHI0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccser2Q3UHI0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccser2Q3UHI0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccser2Q3UHI0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccser2Q3UHI0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccser2Q3UHI0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccser2Q3UHI0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccser2Q3UHI0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccser2Q3UHI0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccser2Q3UHI0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccser2Q3UHI0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccser2Q3UHI0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccser2Q3UHI0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccser2Q3UHI0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccser2Q3UHI0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccser2Q3UHI0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccser2Q3UHI0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccser2Q3UHI0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccser2Q3UHI0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccser2Q3UHI0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccser2Q3UHI0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccser2Q3UHI0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccser2Q3UHI0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccser2Q3UHI0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccser2Q3UHI0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccser2Q3UHI0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccser2Q3UHI0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccser2Q3UHI0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccser2Q3UHI0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccser2Q3UHI0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccser2Q3UHI0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccser2Q3UHI0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccser2Q3UHI0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccser2Q3UHI0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccser2Q3UHI0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccser2Q3UHI0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms