Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plxnd1Q3UH93 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plxnd1Q3UH93 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Plxnd1Q3UH93 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Plxnd1Q3UH93 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Plxnd1Q3UH93 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Plxnd1Q3UH93 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plxnd1Q3UH93 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plxnd1Q3UH93 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plxnd1Q3UH93 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plxnd1Q3UH93 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plxnd1Q3UH93 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plxnd1Q3UH93 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plxnd1Q3UH93 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plxnd1Q3UH93 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plxnd1Q3UH93 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plxnd1Q3UH93 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plxnd1Q3UH93 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plxnd1Q3UH93 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plxnd1Q3UH93 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plxnd1Q3UH93 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plxnd1Q3UH93 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plxnd1Q3UH93 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plxnd1Q3UH93 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plxnd1Q3UH93 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plxnd1Q3UH93 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plxnd1Q3UH93 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plxnd1Q3UH93 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plxnd1Q3UH93 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plxnd1Q3UH93 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plxnd1Q3UH93 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plxnd1Q3UH93 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Plxnd1Q3UH93 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxnd1Q3UH93 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxnd1Q3UH93 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Plxnd1Q3UH93 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Plxnd1Q3UH93 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Plxnd1Q3UH93 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Plxnd1Q3UH93 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Plxnd1Q3UH93 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plxnd1Q3UH93 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plxnd1Q3UH93 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Plxnd1Q3UH93 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Plxnd1Q3UH93 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Plxnd1Q3UH93 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plxnd1Q3UH93 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plxnd1Q3UH93 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plxnd1Q3UH93 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Plxnd1Q3UH93 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plxnd1Q3UH93 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plxnd1Q3UH93 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Plxnd1Q3UH93 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plxnd1Q3UH93 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plxnd1Q3UH93 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plxnd1Q3UH93 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plxnd1Q3UH93 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plxnd1Q3UH93 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plxnd1Q3UH93 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plxnd1Q3UH93 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Plxnd1Q3UH93 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plxnd1Q3UH93 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plxnd1Q3UH93 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plxnd1Q3UH93 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plxnd1Q3UH93 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plxnd1Q3UH93 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plxnd1Q3UH93 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plxnd1Q3UH93 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plxnd1Q3UH93 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plxnd1Q3UH93 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plxnd1Q3UH93 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plxnd1Q3UH93 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plxnd1Q3UH93 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plxnd1Q3UH93 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plxnd1Q3UH93 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plxnd1Q3UH93 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plxnd1Q3UH93 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plxnd1Q3UH93 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plxnd1Q3UH93 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plxnd1Q3UH93 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plxnd1Q3UH93 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plxnd1Q3UH93 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plxnd1Q3UH93 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plxnd1Q3UH93 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Plxnd1Q3UH93 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Plxnd1Q3UH93 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Plxnd1Q3UH93 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms