Protein–RNA interactions for Protein: Q3UC65

Rsrp1, Arginine/serine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsrp1Q3UC65 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsrp1Q3UC65 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsrp1Q3UC65 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsrp1Q3UC65 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsrp1Q3UC65 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsrp1Q3UC65 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsrp1Q3UC65 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsrp1Q3UC65 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsrp1Q3UC65 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsrp1Q3UC65 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rsrp1Q3UC65 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsrp1Q3UC65 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsrp1Q3UC65 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsrp1Q3UC65 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsrp1Q3UC65 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsrp1Q3UC65 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsrp1Q3UC65 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsrp1Q3UC65 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsrp1Q3UC65 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsrp1Q3UC65 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsrp1Q3UC65 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsrp1Q3UC65 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rsrp1Q3UC65 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rsrp1Q3UC65 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsrp1Q3UC65 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsrp1Q3UC65 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsrp1Q3UC65 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsrp1Q3UC65 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsrp1Q3UC65 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsrp1Q3UC65 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsrp1Q3UC65 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsrp1Q3UC65 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsrp1Q3UC65 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsrp1Q3UC65 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsrp1Q3UC65 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsrp1Q3UC65 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsrp1Q3UC65 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsrp1Q3UC65 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsrp1Q3UC65 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsrp1Q3UC65 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsrp1Q3UC65 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsrp1Q3UC65 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsrp1Q3UC65 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsrp1Q3UC65 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsrp1Q3UC65 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsrp1Q3UC65 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsrp1Q3UC65 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsrp1Q3UC65 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rsrp1Q3UC65 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsrp1Q3UC65 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsrp1Q3UC65 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsrp1Q3UC65 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsrp1Q3UC65 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsrp1Q3UC65 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsrp1Q3UC65 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsrp1Q3UC65 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsrp1Q3UC65 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms