Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmem109Q3UBX0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmem109Q3UBX0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmem109Q3UBX0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmem109Q3UBX0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmem109Q3UBX0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmem109Q3UBX0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmem109Q3UBX0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmem109Q3UBX0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmem109Q3UBX0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmem109Q3UBX0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmem109Q3UBX0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmem109Q3UBX0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmem109Q3UBX0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmem109Q3UBX0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmem109Q3UBX0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem109Q3UBX0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem109Q3UBX0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem109Q3UBX0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmem109Q3UBX0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem109Q3UBX0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem109Q3UBX0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem109Q3UBX0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem109Q3UBX0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmem109Q3UBX0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmem109Q3UBX0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmem109Q3UBX0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmem109Q3UBX0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmem109Q3UBX0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmem109Q3UBX0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmem109Q3UBX0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmem109Q3UBX0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tmem109Q3UBX0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmem109Q3UBX0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem109Q3UBX0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem109Q3UBX0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem109Q3UBX0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem109Q3UBX0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem109Q3UBX0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmem109Q3UBX0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmem109Q3UBX0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmem109Q3UBX0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmem109Q3UBX0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmem109Q3UBX0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmem109Q3UBX0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmem109Q3UBX0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmem109Q3UBX0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmem109Q3UBX0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmem109Q3UBX0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmem109Q3UBX0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmem109Q3UBX0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmem109Q3UBX0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmem109Q3UBX0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmem109Q3UBX0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmem109Q3UBX0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmem109Q3UBX0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmem109Q3UBX0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmem109Q3UBX0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmem109Q3UBX0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmem109Q3UBX0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmem109Q3UBX0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmem109Q3UBX0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmem109Q3UBX0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmem109Q3UBX0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmem109Q3UBX0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmem109Q3UBX0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmem109Q3UBX0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmem109Q3UBX0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmem109Q3UBX0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmem109Q3UBX0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmem109Q3UBX0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmem109Q3UBX0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms