Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cops9Q3U898 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cops9Q3U898 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cops9Q3U898 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops9Q3U898 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops9Q3U898 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops9Q3U898 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops9Q3U898 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops9Q3U898 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops9Q3U898 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops9Q3U898 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops9Q3U898 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops9Q3U898 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops9Q3U898 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops9Q3U898 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops9Q3U898 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops9Q3U898 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.6 ms