Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5Q7

Cmpk2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmpk2Q3U5Q7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmpk2Q3U5Q7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmpk2Q3U5Q7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cmpk2Q3U5Q7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cmpk2Q3U5Q7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cmpk2Q3U5Q7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmpk2Q3U5Q7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmpk2Q3U5Q7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmpk2Q3U5Q7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmpk2Q3U5Q7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmpk2Q3U5Q7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmpk2Q3U5Q7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmpk2Q3U5Q7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cmpk2Q3U5Q7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cmpk2Q3U5Q7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cmpk2Q3U5Q7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cmpk2Q3U5Q7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cmpk2Q3U5Q7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cmpk2Q3U5Q7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cmpk2Q3U5Q7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cmpk2Q3U5Q7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cmpk2Q3U5Q7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cmpk2Q3U5Q7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cmpk2Q3U5Q7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cmpk2Q3U5Q7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmpk2Q3U5Q7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmpk2Q3U5Q7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmpk2Q3U5Q7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cmpk2Q3U5Q7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cmpk2Q3U5Q7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmpk2Q3U5Q7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cmpk2Q3U5Q7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cmpk2Q3U5Q7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmpk2Q3U5Q7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmpk2Q3U5Q7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmpk2Q3U5Q7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmpk2Q3U5Q7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmpk2Q3U5Q7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmpk2Q3U5Q7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmpk2Q3U5Q7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmpk2Q3U5Q7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmpk2Q3U5Q7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmpk2Q3U5Q7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms