Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hvcn1Q3U2S8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hvcn1Q3U2S8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hvcn1Q3U2S8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Hvcn1Q3U2S8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hvcn1Q3U2S8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hvcn1Q3U2S8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hvcn1Q3U2S8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hvcn1Q3U2S8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hvcn1Q3U2S8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hvcn1Q3U2S8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hvcn1Q3U2S8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hvcn1Q3U2S8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hvcn1Q3U2S8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hvcn1Q3U2S8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hvcn1Q3U2S8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hvcn1Q3U2S8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hvcn1Q3U2S8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hvcn1Q3U2S8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hvcn1Q3U2S8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hvcn1Q3U2S8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hvcn1Q3U2S8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Hvcn1Q3U2S8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hvcn1Q3U2S8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hvcn1Q3U2S8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Hvcn1Q3U2S8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hvcn1Q3U2S8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hvcn1Q3U2S8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hvcn1Q3U2S8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hvcn1Q3U2S8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Hvcn1Q3U2S8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hvcn1Q3U2S8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hvcn1Q3U2S8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hvcn1Q3U2S8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hvcn1Q3U2S8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hvcn1Q3U2S8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hvcn1Q3U2S8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hvcn1Q3U2S8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hvcn1Q3U2S8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hvcn1Q3U2S8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hvcn1Q3U2S8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hvcn1Q3U2S8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hvcn1Q3U2S8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hvcn1Q3U2S8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hvcn1Q3U2S8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hvcn1Q3U2S8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hvcn1Q3U2S8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hvcn1Q3U2S8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hvcn1Q3U2S8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hvcn1Q3U2S8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hvcn1Q3U2S8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hvcn1Q3U2S8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hvcn1Q3U2S8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hvcn1Q3U2S8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hvcn1Q3U2S8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hvcn1Q3U2S8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hvcn1Q3U2S8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hvcn1Q3U2S8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hvcn1Q3U2S8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hvcn1Q3U2S8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hvcn1Q3U2S8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hvcn1Q3U2S8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hvcn1Q3U2S8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hvcn1Q3U2S8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hvcn1Q3U2S8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hvcn1Q3U2S8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hvcn1Q3U2S8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hvcn1Q3U2S8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms