Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Tbc1d2bQ3U0J8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tbc1d2bQ3U0J8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tbc1d2bQ3U0J8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tbc1d2bQ3U0J8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Tbc1d2bQ3U0J8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tbc1d2bQ3U0J8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tbc1d2bQ3U0J8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tbc1d2bQ3U0J8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tbc1d2bQ3U0J8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tbc1d2bQ3U0J8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tbc1d2bQ3U0J8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tbc1d2bQ3U0J8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tbc1d2bQ3U0J8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms