Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trappc10Q3TLI0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trappc10Q3TLI0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc10Q3TLI0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc10Q3TLI0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc10Q3TLI0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trappc10Q3TLI0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Trappc10Q3TLI0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trappc10Q3TLI0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trappc10Q3TLI0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Trappc10Q3TLI0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Trappc10Q3TLI0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc10Q3TLI0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc10Q3TLI0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc10Q3TLI0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trappc10Q3TLI0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trappc10Q3TLI0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trappc10Q3TLI0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc10Q3TLI0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc10Q3TLI0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trappc10Q3TLI0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Trappc10Q3TLI0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc10Q3TLI0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc10Q3TLI0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trappc10Q3TLI0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc10Q3TLI0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trappc10Q3TLI0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trappc10Q3TLI0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trappc10Q3TLI0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trappc10Q3TLI0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trappc10Q3TLI0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc10Q3TLI0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc10Q3TLI0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trappc10Q3TLI0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trappc10Q3TLI0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trappc10Q3TLI0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc10Q3TLI0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc10Q3TLI0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc10Q3TLI0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc10Q3TLI0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc10Q3TLI0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc10Q3TLI0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc10Q3TLI0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc10Q3TLI0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc10Q3TLI0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trappc10Q3TLI0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trappc10Q3TLI0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trappc10Q3TLI0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trappc10Q3TLI0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Trappc10Q3TLI0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trappc10Q3TLI0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trappc10Q3TLI0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms