Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM30BQ3MIR4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM30BQ3MIR4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM30BQ3MIR4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM30BQ3MIR4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms