Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD55Q3KP44 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD55Q3KP44 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD55Q3KP44 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD55Q3KP44 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD55Q3KP44 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD55Q3KP44 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD55Q3KP44 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD55Q3KP44 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD55Q3KP44 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD55Q3KP44 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD55Q3KP44 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD55Q3KP44 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD55Q3KP44 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD55Q3KP44 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD55Q3KP44 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD55Q3KP44 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD55Q3KP44 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms