Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdss2Q33DR3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdss2Q33DR3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdss2Q33DR3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdss2Q33DR3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdss2Q33DR3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdss2Q33DR3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdss2Q33DR3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdss2Q33DR3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdss2Q33DR3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdss2Q33DR3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdss2Q33DR3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdss2Q33DR3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdss2Q33DR3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdss2Q33DR3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdss2Q33DR3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdss2Q33DR3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdss2Q33DR3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdss2Q33DR3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdss2Q33DR3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdss2Q33DR3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdss2Q33DR3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdss2Q33DR3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdss2Q33DR3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdss2Q33DR3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdss2Q33DR3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdss2Q33DR3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdss2Q33DR3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdss2Q33DR3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pdss2Q33DR3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdss2Q33DR3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdss2Q33DR3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdss2Q33DR3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdss2Q33DR3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdss2Q33DR3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdss2Q33DR3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdss2Q33DR3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdss2Q33DR3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdss2Q33DR3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdss2Q33DR3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdss2Q33DR3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdss2Q33DR3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdss2Q33DR3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdss2Q33DR3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdss2Q33DR3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdss2Q33DR3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdss2Q33DR3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.2 ms