Protein–RNA interactions for Protein: Q2LA85

Treml2, Trem-like transcript 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml2Q2LA85 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Treml2Q2LA85 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Treml2Q2LA85 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Treml2Q2LA85 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Treml2Q2LA85 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Treml2Q2LA85 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Treml2Q2LA85 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Treml2Q2LA85 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Treml2Q2LA85 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Treml2Q2LA85 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Treml2Q2LA85 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Treml2Q2LA85 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Treml2Q2LA85 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Treml2Q2LA85 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Treml2Q2LA85 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Treml2Q2LA85 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Treml2Q2LA85 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Treml2Q2LA85 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Treml2Q2LA85 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Treml2Q2LA85 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Treml2Q2LA85 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Treml2Q2LA85 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Treml2Q2LA85 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Treml2Q2LA85 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Treml2Q2LA85 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Treml2Q2LA85 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Treml2Q2LA85 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Treml2Q2LA85 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Treml2Q2LA85 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Treml2Q2LA85 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Treml2Q2LA85 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Treml2Q2LA85 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Treml2Q2LA85 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Treml2Q2LA85 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Treml2Q2LA85 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Treml2Q2LA85 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Treml2Q2LA85 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Treml2Q2LA85 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Treml2Q2LA85 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Treml2Q2LA85 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Treml2Q2LA85 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Treml2Q2LA85 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Treml2Q2LA85 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Treml2Q2LA85 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Treml2Q2LA85 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Treml2Q2LA85 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms