Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RFX7Q2KHR2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RFX7Q2KHR2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RFX7Q2KHR2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RFX7Q2KHR2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RFX7Q2KHR2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RFX7Q2KHR2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
RFX7Q2KHR2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RFX7Q2KHR2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RFX7Q2KHR2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RFX7Q2KHR2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RFX7Q2KHR2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RFX7Q2KHR2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RFX7Q2KHR2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RFX7Q2KHR2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RFX7Q2KHR2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RFX7Q2KHR2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RFX7Q2KHR2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RFX7Q2KHR2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RFX7Q2KHR2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RFX7Q2KHR2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RFX7Q2KHR2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RFX7Q2KHR2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RFX7Q2KHR2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RFX7Q2KHR2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RFX7Q2KHR2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RFX7Q2KHR2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RFX7Q2KHR2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RFX7Q2KHR2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
RFX7Q2KHR2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RFX7Q2KHR2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RFX7Q2KHR2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RFX7Q2KHR2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RFX7Q2KHR2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RFX7Q2KHR2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RFX7Q2KHR2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RFX7Q2KHR2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RFX7Q2KHR2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RFX7Q2KHR2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RFX7Q2KHR2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RFX7Q2KHR2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RFX7Q2KHR2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
RFX7Q2KHR2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
RFX7Q2KHR2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RFX7Q2KHR2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RFX7Q2KHR2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RFX7Q2KHR2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RFX7Q2KHR2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RFX7Q2KHR2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RFX7Q2KHR2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms