Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MICBQ29980 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MICBQ29980 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MICBQ29980 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MICBQ29980 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MICBQ29980 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MICBQ29980 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MICBQ29980 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MICBQ29980 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MICBQ29980 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MICBQ29980 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MICBQ29980 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MICBQ29980 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MICBQ29980 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MICBQ29980 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MICBQ29980 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MICBQ29980 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MICBQ29980 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MICBQ29980 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MICBQ29980 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MICBQ29980 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MICBQ29980 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MICBQ29980 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MICBQ29980 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MICBQ29980 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MICBQ29980 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MICBQ29980 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MICBQ29980 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MICBQ29980 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MICBQ29980 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MICBQ29980 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MICBQ29980 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MICBQ29980 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MICBQ29980 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MICBQ29980 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MICBQ29980 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MICBQ29980 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MICBQ29980 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MICBQ29980 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MICBQ29980 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MICBQ29980 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MICBQ29980 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MICBQ29980 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MICBQ29980 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MICBQ29980 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MICBQ29980 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MICBQ29980 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MICBQ29980 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MICBQ29980 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MICBQ29980 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MICBQ29980 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MICBQ29980 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MICBQ29980 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MICBQ29980 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MICBQ29980 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MICBQ29980 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MICBQ29980 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MICBQ29980 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MICBQ29980 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MICBQ29980 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MICBQ29980 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MICBQ29980 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MICBQ29980 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MICBQ29980 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MICBQ29980 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MICBQ29980 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MICBQ29980 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MICBQ29980 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MICBQ29980 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MICBQ29980 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MICBQ29980 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MICBQ29980 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MICBQ29980 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MICBQ29980 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MICBQ29980 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MICBQ29980 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MICBQ29980 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MICBQ29980 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MICBQ29980 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MICBQ29980 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MICBQ29980 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MICBQ29980 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MICBQ29980 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MICBQ29980 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MICBQ29980 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MICBQ29980 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICBQ29980 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICBQ29980 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICBQ29980 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICBQ29980 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICBQ29980 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICBQ29980 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICBQ29980 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICBQ29980 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICBQ29980 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICBQ29980 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICBQ29980 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICBQ29980 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MICBQ29980 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICBQ29980 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms