Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC142Q17RM4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC142Q17RM4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC142Q17RM4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC142Q17RM4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC142Q17RM4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC142Q17RM4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC142Q17RM4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC142Q17RM4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC142Q17RM4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC142Q17RM4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC142Q17RM4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC142Q17RM4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC142Q17RM4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC142Q17RM4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC142Q17RM4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC142Q17RM4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC142Q17RM4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC142Q17RM4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC142Q17RM4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC142Q17RM4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC142Q17RM4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC142Q17RM4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC142Q17RM4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC142Q17RM4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC142Q17RM4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC142Q17RM4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC142Q17RM4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC142Q17RM4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC142Q17RM4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC142Q17RM4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC142Q17RM4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC142Q17RM4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC142Q17RM4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC142Q17RM4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC142Q17RM4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC142Q17RM4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC142Q17RM4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC142Q17RM4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC142Q17RM4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC142Q17RM4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC142Q17RM4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
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