Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL8BQ17RB0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL8BQ17RB0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL8BQ17RB0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL8BQ17RB0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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