Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FAM187BQ17R55 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM187BQ17R55 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM187BQ17R55 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAM187BQ17R55 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FAM187BQ17R55 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FAM187BQ17R55 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 287.1 ms