Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDO1Q16878 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDO1Q16878 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDO1Q16878 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDO1Q16878 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDO1Q16878 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDO1Q16878 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDO1Q16878 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDO1Q16878 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDO1Q16878 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDO1Q16878 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDO1Q16878 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDO1Q16878 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDO1Q16878 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDO1Q16878 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDO1Q16878 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDO1Q16878 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDO1Q16878 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDO1Q16878 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDO1Q16878 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDO1Q16878 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDO1Q16878 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDO1Q16878 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDO1Q16878 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDO1Q16878 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDO1Q16878 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDO1Q16878 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDO1Q16878 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDO1Q16878 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDO1Q16878 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDO1Q16878 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDO1Q16878 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDO1Q16878 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDO1Q16878 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDO1Q16878 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDO1Q16878 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDO1Q16878 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDO1Q16878 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDO1Q16878 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDO1Q16878 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CDO1Q16878 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDO1Q16878 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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