Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPL1Q16563 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPL1Q16563 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYPL1Q16563 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYPL1Q16563 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYPL1Q16563 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPL1Q16563 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPL1Q16563 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYPL1Q16563 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYPL1Q16563 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYPL1Q16563 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYPL1Q16563 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYPL1Q16563 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYPL1Q16563 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYPL1Q16563 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYPL1Q16563 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYPL1Q16563 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYPL1Q16563 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYPL1Q16563 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYPL1Q16563 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYPL1Q16563 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYPL1Q16563 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPL1Q16563 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYPL1Q16563 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYPL1Q16563 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYPL1Q16563 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYPL1Q16563 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYPL1Q16563 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYPL1Q16563 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYPL1Q16563 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPL1Q16563 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPL1Q16563 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPL1Q16563 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL1Q16563 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYPL1Q16563 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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