Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRY1Q16526 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CRY1Q16526 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRY1Q16526 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRY1Q16526 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRY1Q16526 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRY1Q16526 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY1Q16526 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRY1Q16526 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRY1Q16526 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRY1Q16526 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRY1Q16526 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRY1Q16526 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRY1Q16526 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CRY1Q16526 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRY1Q16526 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRY1Q16526 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRY1Q16526 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRY1Q16526 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRY1Q16526 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRY1Q16526 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRY1Q16526 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRY1Q16526 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRY1Q16526 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRY1Q16526 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRY1Q16526 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CRY1Q16526 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRY1Q16526 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRY1Q16526 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRY1Q16526 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRY1Q16526 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRY1Q16526 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms