Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX2Q16385 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX2Q16385 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX2Q16385 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX2Q16385 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX2Q16385 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX2Q16385 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX2Q16385 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX2Q16385 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX2Q16385 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSX2Q16385 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSX2Q16385 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX2Q16385 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSX2Q16385 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX2Q16385 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX2Q16385 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX2Q16385 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX2Q16385 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX2Q16385 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX2Q16385 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX2Q16385 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SSX2Q16385 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSX2Q16385 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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