Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETFDHQ16134 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETFDHQ16134 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ETFDHQ16134 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETFDHQ16134 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ETFDHQ16134 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ETFDHQ16134 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ETFDHQ16134 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ETFDHQ16134 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETFDHQ16134 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETFDHQ16134 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETFDHQ16134 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETFDHQ16134 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETFDHQ16134 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETFDHQ16134 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETFDHQ16134 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETFDHQ16134 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ETFDHQ16134 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ETFDHQ16134 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETFDHQ16134 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETFDHQ16134 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms