Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMCHL1Q16048 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMCHL1Q16048 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMCHL1Q16048 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMCHL1Q16048 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMCHL1Q16048 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMCHL1Q16048 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMCHL1Q16048 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMCHL1Q16048 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMCHL1Q16048 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMCHL1Q16048 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms