Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFHX3Q15911 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFHX3Q15911 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZFHX3Q15911 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZFHX3Q15911 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFHX3Q15911 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFHX3Q15911 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFHX3Q15911 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFHX3Q15911 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFHX3Q15911 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFHX3Q15911 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFHX3Q15911 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFHX3Q15911 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFHX3Q15911 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFHX3Q15911 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFHX3Q15911 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFHX3Q15911 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFHX3Q15911 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFHX3Q15911 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFHX3Q15911 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFHX3Q15911 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFHX3Q15911 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFHX3Q15911 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFHX3Q15911 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFHX3Q15911 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFHX3Q15911 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFHX3Q15911 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFHX3Q15911 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFHX3Q15911 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFHX3Q15911 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFHX3Q15911 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFHX3Q15911 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZFHX3Q15911 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ZFHX3Q15911 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFHX3Q15911 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFHX3Q15911 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFHX3Q15911 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFHX3Q15911 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFHX3Q15911 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFHX3Q15911 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFHX3Q15911 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFHX3Q15911 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFHX3Q15911 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFHX3Q15911 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFHX3Q15911 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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